O respeito ao meio ambiente é prioridade para a Eletronorte. Seus empreendimentos são acompanhados de programas de educação ambiental, de saúde, de recuperação de áreas degradadas, de indenização e desapropriação. No Amazonas, a Empresa mantém convênio com o Ibama para a manutenção da Reserva Biológica do Uatumã. Com 960 mil hectares, é a maior unidade de conservação ambiental do Brasil. Foi criada com o objetivo de preservar a biodiversidade amazônica, pesquisar quelônios e mamíferos aquáticos e desenvolver estudos científicos. A Eletronorte mantém ainda dois programas de proteção de espécies nativas na área de Balbina: o Centro de Preservação e Pesquisas de Quelônios Aquáticos, voltado para o estudo de animais como a tartarugada- amazônia e o tracajá, e o Centro de Preservação e Pesquisa de Mamíferos Aquáticos, que estuda e protege espécies como o peixe-boi da Amazônia, o boto-vermelho e o boto-tucuxi.
